|
| |
|
| |
|
|
|
Opgepoetst | 16-2-2019
Greenomics brengt DNA van melkzuurbacterie in kaart
Voor de eerste keer in zijn geschiedenis heeft het DLO-centrum Greenomics opdracht gekregen om het volledige DNA van een organisme in kaart te brengen. Het gaat om de melkzuurbacterie Lactobacillus. De opdracht komt van het Wagenings Food Science Centre. Lactobacillus speelt een cruciale rol in de zuivelindustrie, bijvoorbeeld bij het maken van kaas. Naar schatting bestuderen zo'n veertig tot vijftig Nederlandse onderzoekers deze bacterie.
Wanneer eenmaal de volgorde en de positie van de 2,8 miljoen genen in beeld is, hoopt Greenomics gerichter te kunnen zoeken naar nieuwe mogelijkheden voor de bacterie. "Door dit project krijgen we inzicht in de factoren die de groei en het functioneren van de bacterie beinvloeden", vertelt prof. dr Willem Stiekema, woordvoerder van Greenomics. "We kijken bijvoorbeeld naar hoe de temperatuur de groei beinvloedt. Niet op het niveau van een enkel gen, zoals tot op heden is gebeurd, maar op niveau van alle genen."
Het project is niet direct gericht op het genetisch manipuleren van de melkzuurbacterie, zegt Stiekema. "Dit is fundamenteel onderzoek. Bedrijven kunnen de resultaten gebruiken om de bacterie te modificeren, maar ook om de condities te optimaliseren waaronder de bacterie gedijt."
Het Wageningen Food Science Centre heeft voor het project een paar miljoen gulden uitgetrokken. De hoge kosten worden veroorzaakt door de apparatuur. Het laboratorium van Greenomics beschikt over geavanceerde DNA-sequencers, waarmee het zo'n anderhalf miljoen baseparen per dag kan sequencen.
Stiekema is echter niet van het bedrag onder de indruk. "Peanuts", vindt hij. "Vergelijk het maar met projecten in de fysica. Als je kijkt naar wat het CERN in Geneve kost, waar ze met elementaire deeltjes in de weer zijn, dan zijn die paar miljoen van dit project natuurlijk niet zoveel."
Greenomics wil het project binnen een jaar afronden.
Weekblad voor Wageningen UR, 20 mei 1999.